生态系统中的能量流和物质循环在没有受到外力的剧烈干扰情况下，总是平稳进行，生态系统结构也保持相对稳定状态，叫做生态平衡，包括生态系统内两方面的稳定：生物种类的组成和数量比例相对稳定;非生物环境保持相对稳定。
生态平衡是整个生物圈保持正常的生命维持系统的重要条件，为人类提供适宜的环境条件和稳定的物质资源。生态系统一旦失去平衡，会发生非常严重的连锁性后果。例如将麻雀作为"四害"大量捕杀后出现的严重虫灾，使农业生产受到巨大的损失;江浙水域发生的大规模赤潮污染水体导致鱼类大量死亡。
